一、注重地面材料
洁净室的施工首先要考虑的是地面部分，一般的洁净室施工地面是不需要承载负荷的，那么就可以考虑用一些物美价廉的装饰材料，比如地板砖或者复合木地板等来做洁净室地面施工材料，有的洁净室在施工时要考虑防静电，那么就要选择防静电地板或防环氧地坪等来做为施工地面的首选材料，还有的洁净室在施工时需要地面承载负荷，那么就必须要在地面基层做混凝土，混凝土分为商业混凝土和土做法混凝土两种，前者造价略高但质量稳定，后者价格较低质量一般，然后在混凝土基层上再铺设其他质地比较坚硬的石材做饰面即可。
二、合理的顶面设计
另外在洁净室施工时还要注意的是顶部，洁净室的顶部通常较高，且大多数都是钢结构框架，在施工顶部时先要设计消防、通风、及中央空调的合理安排，因为这些都是洁净室的施工中必要的硬件设施，尤其是消防。接下来就是根据使用的要求来确定是否吊顶的问题了，洁净室吊顶的材料很多，如果为了美观些可以用矿棉吸音板、石膏板、铝塑板等材料来为顶部做装饰，还可以不做任何吊顶，把顶部需要隐藏的或者不美观的一些设施做局部的修饰也是一种现代的、简约主义设计。
三、有效的空间划分
洁净室内部空间划分主要是经营者根据自己的实际使用要求来进行合理的利用空间，如果厂区内有众多洁净设备，则不宜设置太多隔断及隔墙，尽量以地面的色调或者用一些有色标识来进行划分区域，用标识划分区域要避免色系过多，那样不但区域划分不明显还会令人感觉头晕目眩，还有的洁净室可以明确的划分出设备区与办公区，这样的规划现在比较常见，因为便于管理。那么在设计这样的厂区时一定要掌握好数据与各个空间的紧密结合，同时还要考虑到设备区与办公区的工作距离是流畅以及灰尘、噪音的干扰。
