风淋式传递窗主要用于洁净区和洁净区之间或洁净区和非洁净区之间的小件物品的传递，通过吹淋方式利用通过净化后的空气高速把产品上表面的灰尘吹掉, 从而避免把产品表面的灰尘带入洁净区。
层流传递窗主要用于洁净区和洁净区之间或洁净区和非洁净区之间的物品的传递(主要应用于生物制药行业), 其原理是通过层流自净的方式把打开门后在放置产品过程中带入传递窗的灰尘。层流传递窗的风速一般在0.3-0.8米/秒, 通过层流过滤的形式, 使传递窗内部形成一个百级的净化环境, 从而使在洁净区内打开门后不会形成污染; 在层流自净的过程中,往往会通过时间继电器控制传递窗的门锁, 如果没有到达自净的时候, 传递窗的门是打不开的;
风淋传递窗的内部因为其结构和风速决定了其净化程度只能达到千级的净化效果, 而层流传递窗的一个基本要求,最少也要达到千级, 最高可达到十级甚至一级的效果;
在制药行业新版GMP对传递窗的管理要求中, 因为许多生产车间都是百级甚至十级的区域, 为了避免传递物对洁净室的影响, 新版GMP对传递窗的要求比以往提高了许多, 所以以往的风淋传递窗的作用就不符合要求, 必须要用层流传递窗以避免污染其生产环境,；新版GMP传递窗在于严格按照自净时间，没有达到自净时间无法取出物品，从而达到GMP管理要求。
所以,选用此两款传递窗最重要的个问题就是取决于其用途.
